RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	PKP2	Q99959	881 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	WAC	Q9BTA9	647 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	APOO	Q9BUR5	198 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MBD2	Q9UBB5	411 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	VWA7	Q9Y334	891 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SPTA1	P02549	2419 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	C7orf72	A4D263	438 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF1	P05230	155 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DPA1	P20036	260 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MYF6	P23409	242 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ETV4	P43268	484 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIA4	P48058	902 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MLLT10	P55197	1068 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NFATC2	Q13469	925 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FLOT2	Q14254	428 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MSS51	Q4VC12	460 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	STPG1	Q5TH74	334 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	AGAP6	Q5VW22	663 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPD8	Q6UX82	237 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDH26	Q8IXH8	852 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LILRA2	Q8N149	483 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PDIK1L	Q8N165	341 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM47B	Q8NA70	645 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGED4	Q96JG8	741 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	AGAP4	Q96P64	663 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NRTN	Q99748	197 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BTBD2	Q9BX70	525 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNG2	Q9Y698	323 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CKAP5	Q14008	2032 aa		7	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MSH3	P20585	1137 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BGN	P21810	368 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IL12A	P29459	219 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SSTR1	P30872	391 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DDOST	P39656	456 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ELK3	P41970	407 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIA3	P42263	894 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PREP	P48147	710 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK3	Q00526	305 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BAMBI	Q13145	260 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PNCK	Q6P2M8	343 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RANBP10	Q6VN20	620 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PALM2	Q8IXS6	379 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF786	Q8N393	782 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB7B	Q96AH8	199 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DTD2	Q96FN9	168 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KIFC1	Q9BW19	673 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FBRS	Q9HAH7	460 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	AKAP10	O43572	662 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC14L2	O76054	403 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	YES1	P07947	543 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SYP	P08247	313 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TYRP1	P17643	537 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRM3	P20309	590 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	EPHA3	P29320	983 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CD40LG	P29965	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FMO4	P31512	558 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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