RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX31Q8N9S9 440 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPV3Q8NET8 790 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TTLQ8NG68 377 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MZB1Q8WU39 189 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 COL26A1Q96A83 441 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 IP6K3Q96PC2 410 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF358Q9NW07 568 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 GFAPP14136 432 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 EPORP19235 508 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 FOLR3P41439 243 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CCR10P46092 362 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 AVPR1BP47901 424 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 AGTR2P50052 363 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS1Q08116 209 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 LAPTM5Q13571 262 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 IL10RAQ13651 578 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC9A5Q14940 896 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PFKFB4Q16877 469 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD53Q8N9V6 530 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 KCT2Q8NC54 265 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 EXTL1Q92935 676 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CAVIN3Q969G5 261 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 OPTCQ9UBM4 332 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB21Q9UL25 225 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB1Q9Y576 335 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 STX16O14662 325 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF4O60810 478 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 WFS1O76024 890 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINA6P08185 405 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT17P0C025 328 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SFTPCP11686 197 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EPB42P16452 691 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 IRF8Q02556 426 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OCA2Q04671 838 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 DOC2AQ14183 400 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 XKR6Q5GH73 641 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB43Q86YS6 212 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SCYL1Q96KG9 808 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SPSB2Q99619 263 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MACROD1Q9BQ69 325 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 XPR1Q9UBH6 696 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FER1L5A0AVI2 2057 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 URADA6NGE7 173 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFS4O43181 175 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM24O75264 130 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CDH16O75309 829 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHEP01854 428 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 UMODP07911 640 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTA1P08263 222 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PIK3CGP48736 1102 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CHIT1Q13231 466 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 HERC3Q15034 1050 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms