RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 GPIP06744 558 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANXA6P08133 673 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ACADMP11310 421 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMB5P28074 263 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFALSP35858 605 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN2P57739 230 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP2CBP62714 309 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP2CAP67775 309 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH1Q08174 1060 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT33BQ14525 404 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 AGERQ15109 404 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PDK3Q15120 406 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG9BQ674R7 924 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C17orf64Q86WR6 236 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HORMAD1Q86X24 394 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CLECL1Q8IZS7 167 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf111Q8N326 155 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OXR1Q8N573 874 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5K2Q8NHB8 316 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO30Q8TB52 745 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NCLNQ969V3 563 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CNBD2Q96M20 576 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GABRG3Q99928 467 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 APOOQ9BUR5 198 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CHID1Q9BWS9 393 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 Q9H521 79 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 XKR8Q9H6D3 395 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRE2Q9UHX3 823 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MTCH2Q9Y6C9 303 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 COL4A3Q01955 1670 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 POM121BA6NF01 834 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52A4PA6NMU1 304 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GABRR3A8MPY1 467 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 EVPLLA8MZ36 301 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 H7BY64 318 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SOCS2O14508 198 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPNS1P04632 268 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CEACAM5P06731 702 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ASGR2P07307 311 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 UMPSP11172 480 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BMP2P12643 396 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GGT1P19440 569 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP4F2P78329 520 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2A13Q16696 494 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SPIN4Q56A73 249 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LRIF1Q5T3J3 769 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CPTPQ5TA50 214 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CBR4Q8N4T8 237 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLM1Q8NBJ4 401 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FLCNQ8NFG4 579 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR48Q8TAF3 677 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NELL1Q92832 810 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM162AQ96A26 154 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FCRL1Q96LA6 429 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HAUS8Q9BT25 410 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DUSP26Q9BV47 211 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK12Q9HB15 430 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB26Q9ULW5 256 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SUFUQ9UMX1 484 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FEZF1A0PJY2 475 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.82□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 H0Y8X5 98 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms