RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370882.1

LRRC1-201, Transcript of leucine rich repeat containing 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LRRC1, Length 808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1-201ENST00000370882 FOLR3P41439 243 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 OR1D4P47884 311 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 AVPR1BP47901 424 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 PIK3CGP48736 1102 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 SKP1P63208 163 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 NFKB2Q00653 900 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 RGS1Q08116 209 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 LAPTM5Q13571 262 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 SLC9A5Q14940 896 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 TBCCQ15814 346 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 XKR6Q5GH73 641 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 BORAQ6PGQ7 559 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 WDR34Q96EX3 536 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 NT5DC2Q9H857 520 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 ZNF358Q9NW07 568 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 COPG2Q9UBF2 871 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRC1-201ENST00000370882 CDC14CA4D256 554 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 URADA6NGE7 173 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 H0YIG0 161 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 MED26O95402 600 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 GSTA1P08263 222 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 AGTR2P50052 363 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 IRF8Q02556 426 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 OCA2Q04671 838 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 27.4
LRRC1-201ENST00000370882 RAB43Q86YS6 212 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 NT5CQ8TCD5 201 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 MZB1Q8WU39 189 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 TTC9Q92623 222 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 NACC2Q96BF6 587 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 IP6K3Q96PC2 410 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 RAB21Q9UL25 225 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 KRT15P19012 456 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 CASP2P42575 452 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 CCR10P46092 362 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 SLCO1A2P46721 670 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 PCDH1Q08174 1060 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 IL10RAQ13651 578 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 SSPNQ14714 243 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 HERC3Q15034 1050 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 TBR1Q16650 682 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 COX15Q7KZN9 410 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 MREGQ8N565 214 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 UBE2E3Q969T4 207 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ASB1Q9Y576 335 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 CACNA1GO43497 2377 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ATMQ13315 3056 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 SMIM23A6NLE4 172 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 STX16O14662 325 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 FOXS1O43638 330 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 STATHP02808 62 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 SERPIND1P05546 499 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 PYGBP11216 843 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 CHIT1Q13231 466 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 DOC2AQ14183 400 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 E2F2Q14209 437 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 NKG7Q16617 165 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ABHD13Q7L211 337 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 KCT2Q8NC54 265 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC1-201ENST00000370882 EXTL1Q92935 676 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms