RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 APH1BQ8WW43 257 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 FOXJ1Q92949 421 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 C7orf34Q96L11 122 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SERTM1A2A2V5 107 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 OR2AG2A6NM03 316 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PRMT3O60678 531 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 C9P02748 559 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CD36P16671 472 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SP140Q13342 867 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 DNASE1L3Q13609 305 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 DOC2AQ14183 400 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 DUSP26Q9BV47 211 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 GABRR3A8MPY1 467 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 RFPL2O75678 378 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 VIPP01282 170 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ADH1AP07327 375 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TYRP14679 529 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TGFBR2P37173 567 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNJ10P78508 379 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 MVKQ03426 396 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 LIPJQ5W064 366 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 Q6ZVL8 140 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 DNASE1L2Q92874 299 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 MED8Q96G25 268 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNC2Q96PR1 638 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 RUBCNLQ9H714 662 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 OR2A25A4D2G3 310 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM202A6NGA9 273 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC16A5O15375 505 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ETHE1O95571 254 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 WEE1P30291 646 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ETV3P41162 512 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 VEZF1Q14119 521 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TEAD2Q15562 447 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SYT16Q17RD7 645 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PITX2Q99697 317 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CEP44Q9C0F1 390 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.24■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 C5orf42Q9H799 3197 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PCSK2P16519 638 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 RRM2P31350 389 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CASP9P55211 416 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 HKDC1Q2TB90 917 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM215Q68D42 235 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PLD3Q8IV08 490 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 MTG2Q9H4K7 406 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC34A8MYJ7 566 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SUV39H1O43463 412 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 GAB1Q13480 694 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CPTPQ5TA50 214 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 IRF7Q92985 503 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 AMBNQ9NP70 447 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF6Q9Y252 685 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 HIDE1A8MVS5 230 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 EFCAB9A8MZ26 197 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 SGTAO43765 313 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 LEFTY1O75610 366 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 NAE1Q13564 534 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 MAPK11Q15759 364 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM124AQ86V42 546 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 GPR156Q8NFN8 814 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS2-201ENST00000308020 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms