RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PCSK5Q92824 1860 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 RIPK2O43353 540 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 KERAO60938 352 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 KRT38O76015 456 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 WDR47O94967 919 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MYBL2P10244 700 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MMP11P24347 488 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 GCAP28676 217 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 HSPA7P48741 367 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 IRF9Q00978 393 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 OCA2Q04671 838 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 C19orf57Q0VDD7 668 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 DSG2Q14126 1118 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SLC29A2Q14542 456 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 FBXO48Q5FWF7 155 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ATG9BQ674R7 924 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ASPGQ86U10 573 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 RAB43Q86YS6 212 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MIEF2Q96C03 454 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MOCOSQ96EN8 888 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 AIF1LQ9BQI0 150 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TMEM79Q9BSE2 394 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 CD244Q9BZW8 370 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 EPB41L4BQ9H329 900 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 EHD1Q9H4M9 534 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 NT5DC2Q9H857 520 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MLXIPLQ9NP71 852 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 COPG2Q9UBF2 871 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ARGFXA6NJG6 315 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 B8ZZF3 427 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 H0YIG0 161 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 CEACAM4O75871 244 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 DNAJB5O75953 348 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 IGHEP01854 428 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 STATHP02808 62 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 COL6A2P12110 1019 aa7.99□□□□□ -1.13
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PPARG-201ENST00000287820 CXCR2P25025 360 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 OTX2P32243 289 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 CASP2P42575 452 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 CCL11P51671 97 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 KLC1Q07866 573 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PCDH1Q08174 1060 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 CDC16Q13042 620 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ATP1A4Q13733 1029 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 E2F2Q14209 437 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TRPV3Q8NET8 790 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 WDR34Q96EX3 536 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SMIM10Q96HG1 83 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ACSS2Q9NR19 701 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ZNF358Q9NW07 568 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 WWOXQ9NZC7 414 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 SYCE1LA8MT33 242 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 K7EM74 188 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 AGPSO00116 658 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 UBXN8O00124 270 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PEX12O00623 359 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 KLK8O60259 260 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 RFPL1O75677 317 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 WFS1O76024 890 aa7.98□□□□□ -1.13
PPARG-201ENST00000287820 BMP10O95393 424 aa7.98□□□□□ -1.13
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