RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 PAX3P23760 479 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LIPAP38571 399 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RAB33AQ14088 237 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TMC8Q8IU68 726 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CCDC103Q8IW40 242 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FIBINQ8TAL6 211 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RORBQ92753 470 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PRR14Q9BWN1 585 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CERS4Q9HA82 394 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FEZF1A0PJY2 475 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FUOMA2VDF0 154 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GLOD5A6NK44 160 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PCDH17O14917 1159 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 BMP4P12644 408 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GSTM2P28161 218 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IMPA1P29218 277 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A12P48065 614 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NRIP1P48552 1158 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NFE2L1Q14494 772 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MPPE1Q53F39 396 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RNF130Q86XS8 419 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 OR7G3Q8NG95 312 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SPG21Q9NZD8 308 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RAB23Q9ULC3 237 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MGAT4DA6NG13 374 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 M0QX08 132 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GFRA2O00451 464 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MMP20O60882 483 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ADAM23O75077 832 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 STSP08842 583 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TIMP2P16035 220 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PSMA3P25788 255 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IRS1P35568 1242 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SMARCB1Q12824 385 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 COLEC12Q5KU26 742 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CPTPQ5TA50 214 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SHISA5Q8N114 240 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 APH1BQ8WW43 257 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TMEM159Q96B96 161 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 AP2M1Q96CW1 435 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CCDC115Q96NT0 180 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DOK1Q99704 481 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MUC13Q9H3R2 512 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RMND5AQ9H871 391 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PCM1Q15154 2024 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 EFEMP2O95967 443 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 HPCAL1P37235 193 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A11P48066 632 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R50P59544 299 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NOGQ13253 232 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CLCA4Q14CN2 919 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 INAQ16352 499 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MPEG1Q2M385 716 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FAM124AQ86V42 546 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PLPP6Q8IY26 295 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 BORCS5Q969J3 196 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MUL1Q969V5 352 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NXPE3Q969Y0 559 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms