RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Oog2Q7TPX8 476 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Peli3Q8BXR6 445 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gramd1cQ8CI52 457 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr985Q8VGB4 311 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nmnat1Q9EPA7 285 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 DstnQ9R0P5 165 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr49Q9Z1V0 313 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1306A2BFL7 312 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 IpmkQ7TT16 396 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cfap20Q8BTU1 193 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc41a2Q8BYR8 573 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fndc5Q8K4Z2 209 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rnf111Q99ML9 989 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1508Q9R0K4 310 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Col11a2Q64739 1736 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm13078A2AGW8 474 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mgat4eA6H684 439 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm340F6RGI3 1242 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm10479K7N6H4 105 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rps13P62301 151 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tgtp2Q3T9E4 415 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Itga7Q61738 1179 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tgtp1Q62293 415 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam72aQ8BFZ8 149 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdc73Q8JZM7 531 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr846Q8VET8 312 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Uqcc2Q9CQY6 136 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Smurf1Q9CUN6 731 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 RgrQ9Z2B3 291 aa13.1□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm3138K7N754 218 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gsta1P13745 223 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 CatP24270 527 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mmp11Q02853 492 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bcl2a1Q07440 172 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Syndig1lQ3USQ7 237 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mylk4Q5SUV5 386 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gsta1Q6P8Q0 223 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dalrd3Q6PJN8 538 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tas2r13Q7M720 305 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 InavaQ7TN12 663 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ccdc116Q80X53 541 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PpcdcQ8BZB2 204 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 RybpQ8CCI5 228 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ppwd1Q8CEC6 646 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr853Q8VGG6 305 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Satb2Q8VI24 733 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nup205A0A0J9YUD5 2061 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Clk4O35493 481 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ring1O35730 406 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cd160O88875 185 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Atp1b2P14231 290 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Etv4P28322 485 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam117bQ3U3E2 584 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kmt5cQ6Q783 468 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znf423Q80TS5 1292 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gpr62Q80UC6 358 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znf322Q8BZ89 410 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zbtb6Q8K088 423 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Igsf8Q8R366 611 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1346Q8VGH6 313 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pex16Q91XC9 336 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmp1Q99KU0 406 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q9CPZ3 230 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gpn3Q9D3W4 284 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Exosc1Q9DAA6 195 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm21800J3QMJ9 180 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Scn2bQ56A07 215 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdk6Q64261 326 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr855Q7TRF8 312 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sumf2Q8BPG6 308 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NpntQ91V88 561 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tubd1Q9R1K7 455 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rem1O35929 297 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rph3aP47708 681 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Aff3P51827 1254 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sec24dQ6NXL1 1032 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rrm2bQ6PEE3 351 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PgghgQ8BP56 690 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trib2Q8K4K3 343 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp773Q9CZ29 471 aa13.09□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Plxnb2B2RXS4 1842 aa13.08□□□□□ -0.31
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa13.08□□□□□ -0.32
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sult3a1O35403 293 aa13.08□□□□□ -0.32
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr681Q3SXH8 315 aa13.08□□□□□ -0.32
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms