Protein–RNA interactions for Protein: Q07440

Bcl2a1, Bcl-2-related protein A1, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl2a1Q07440 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Bcl2a1Q07440 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Bcl2a1Q07440 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Bcl2a1Q07440 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Bcl2a1Q07440 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Bcl2a1Q07440 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Bcl2a1Q07440 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Bcl2a1Q07440 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Bcl2a1Q07440 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Bcl2a1Q07440 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Bcl2a1Q07440 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Bcl2a1Q07440 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Bcl2a1Q07440 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Bcl2a1Q07440 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Bcl2a1Q07440 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Bcl2a1Q07440 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Bcl2a1Q07440 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Bcl2a1Q07440 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Bcl2a1Q07440 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bcl2a1Q07440 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Bcl2a1Q07440 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Bcl2a1Q07440 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Bcl2a1Q07440 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Bcl2a1Q07440 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl2a1Q07440 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl2a1Q07440 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bcl2a1Q07440 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Bcl2a1Q07440 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Bcl2a1Q07440 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Bcl2a1Q07440 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Bcl2a1Q07440 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Bcl2a1Q07440 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bcl2a1Q07440 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Bcl2a1Q07440 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bcl2a1Q07440 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl2a1Q07440 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Bcl2a1Q07440 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bcl2a1Q07440 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bcl2a1Q07440 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bcl2a1Q07440 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bcl2a1Q07440 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bcl2a1Q07440 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Bcl2a1Q07440 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bcl2a1Q07440 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bcl2a1Q07440 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl2a1Q07440 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl2a1Q07440 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bcl2a1Q07440 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl2a1Q07440 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bcl2a1Q07440 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bcl2a1Q07440 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl2a1Q07440 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Bcl2a1Q07440 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bcl2a1Q07440 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bcl2a1Q07440 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bcl2a1Q07440 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Bcl2a1Q07440 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bcl2a1Q07440 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bcl2a1Q07440 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bcl2a1Q07440 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bcl2a1Q07440 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl2a1Q07440 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl2a1Q07440 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl2a1Q07440 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Bcl2a1Q07440 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl2a1Q07440 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl2a1Q07440 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl2a1Q07440 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl2a1Q07440 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bcl2a1Q07440 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl2a1Q07440 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bcl2a1Q07440 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl2a1Q07440 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl2a1Q07440 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl2a1Q07440 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl2a1Q07440 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl2a1Q07440 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl2a1Q07440 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl2a1Q07440 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl2a1Q07440 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl2a1Q07440 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl2a1Q07440 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl2a1Q07440 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl2a1Q07440 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl2a1Q07440 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl2a1Q07440 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl2a1Q07440 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bcl2a1Q07440 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bcl2a1Q07440 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl2a1Q07440 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl2a1Q07440 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl2a1Q07440 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl2a1Q07440 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl2a1Q07440 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl2a1Q07440 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl2a1Q07440 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl2a1Q07440 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl2a1Q07440 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl2a1Q07440 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl2a1Q07440 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms