RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 CAMKVQ8NCB2 501 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ABHD11Q8NFV4 315 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 OR2Y1Q8NGV0 311 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 STAG3L4Q8TBR4 150 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 NXNL1Q96CM4 212 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MACROD1Q9BQ69 325 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 DRC3Q9H069 523 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 VPS11Q9H270 941 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ADNPQ9H2P0 1102 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PELI2Q9HAT8 420 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 IGSF5Q9NSI5 407 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CTSFQ9UBX1 484 aa12□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TRBC2A0A5B9 178 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TAPBPO15533 448 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 RIPK2O43353 540 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KERAO60938 352 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 RFPL1O75677 317 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KRT38O76015 456 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ONECUT2O95948 504 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SERPIND1P05546 499 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ABHD2P08910 425 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.99□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 HSPA7P48741 367 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 OCA2Q04671 838 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CDC16Q13042 620 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CHAF1BQ13112 559 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ATP1A4Q13733 1029 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SSPNQ14714 243 aa11.99□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CPZQ66K79 652 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KLC3Q6P597 504 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ISCA2Q86U28 154 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SNX31Q8N9S9 440 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PDPRQ8NCN5 879 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ESAMQ96AP7 390 aa11.99□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR54Q9H977 334 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ACSS2Q9NR19 701 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 SYCE1LA8MT33 242 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 UBXN8O00124 270 aa11.98□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 FFAR3O14843 346 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 GPR42O15529 346 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 NDUFS4O43181 175 aa11.98□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 UMODP07911 640 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CNTFP26441 200 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 AVPR1BP47901 424 aa11.98□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 DSG2Q14126 1118 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MRGPREQ86SM8 312 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KCT2Q8NC54 265 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.98□□□□□ -0.49
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