RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM89BQ8N5H3 189 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TCEANCQ8N8B7 351 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4D10Q8NGI6 311 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DEDD2Q8WXF8 326 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PIK3R3Q92569 461 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C16orf74Q96GX8 76 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBXN10Q96LJ8 280 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C8orf48Q96LL4 319 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DACH2Q96NX9 599 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEDD4LQ96PU5 975 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SERINC2Q96SA4 455 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCT8L2Q96SF2 557 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAP7D2Q96T17 732 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STRADBQ9C0K7 418 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNMDQ9H2S6 317 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WDR41Q9HAD4 459 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRPV4Q9HBA0 871 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLCB1Q9NQ66 1216 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PKD2L2Q9NZM6 624 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLRF1Q9NZS2 232 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPATA2Q9UM82 520 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIM17Q9Y577 477 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCM1Q15154 2024 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNRQ92752 1358 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCT8L1PA6NM43 557 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC1A7O00341 560 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 E2F3O00716 465 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PARNO95453 639 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHG1P01857 330 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRLRP16471 622 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCNE1P24864 410 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNTFP26441 200 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ABCD3P28288 659 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OAS2P29728 719 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAFAH1B1P43034 410 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC25A1P53007 311 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARL4CP56559 192 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR1D5P58170 312 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGCGQ13326 291 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRMP1Q14194 572 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HERPUD1Q15011 391 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ABRAXAS2Q15018 415 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCNG2Q16589 344 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DUSP5Q16690 384 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCK2Q16822 640 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AGAP6Q5VW22 663 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACSM2BQ68CK6 577 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC24A5Q71RS6 500 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCRLAQ7L513 359 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC22A15Q8IZD6 547 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCYL3Q8IZE3 742 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LGI2Q8N0V4 545 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF182Q8N6D2 247 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 THAP8Q8NA92 274 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR9Q2Q8NGE9 314 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MOSPD2Q8NHP6 518 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC107Q8WV48 283 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGCDQ92629 289 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMARCE1Q969G3 411 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAF2Q96CS3 445 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HVCN1Q96D96 273 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF125Q96EQ8 232 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2A14Q96R47 310 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBP1Q9H171 429 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GKN1Q9NS71 199 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HACD3Q9P035 362 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLK11Q9UBX7 282 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AMACRQ9UHK6 382 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC189A1A4V9 331 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF233A6NK53 670 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF487B1APH4 448 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF103O00237 685 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRT33AO76009 404 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYL1P05976 194 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBL4AP11441 157 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AADACP22760 399 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR183P32249 361 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRPC1P48995 793 aa0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms