RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SPNS1Q9H2V7 528 aa19.94■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 CD274Q9NZQ7 290 aa19.94■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 TLK1Q9UKI8 766 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 RNF112Q9ULX5 631 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 KCNE2Q9Y6J6 123 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ATMQ13315 3056 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa19.93■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF843Q8N446 348 aa19.92■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 GPR78Q96P69 363 aa19.92■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 EPB41L4BQ9H329 900 aa19.92■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 IKBKGQ9Y6K9 419 aa19.92■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 I3L1I5 382 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 HSPA7P48741 367 aa19.91■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 EXT2Q93063 718 aa19.91■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MRGPREQ86SM8 312 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD53Q8N9V6 530 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 STT3BQ8TCJ2 826 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MOCOSQ96EN8 888 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ABHD17AQ96GS6 310 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 AIF1LQ9BQI0 150 aa19.9■□□□□ 0.78
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