RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.13□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 MAP2K7O14733 419 aa11.13□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 ZIM3Q96PE6 472 aa11.12□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CUTCQ9NTM9 273 aa11.12□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 ZBTB14O43829 449 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 PIAS1O75925 651 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MATN4O95460 622 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MLYCDO95822 493 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SHBGP04278 402 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ABHD2P08910 425 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MPC1LP0DKB6 136 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CXCR2P25025 360 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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