RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404025.2

NLRC4-204, Transcript of NLR family CARD domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NLRC4, Length 3,581 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4-204ENST00000404025 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 OR4K3Q96R72 315 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 OR51B5Q9H339 312 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SUV39H1O43463 412 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 NDUFS2O75306 463 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SEC14L2O76054 403 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PRPH2P23942 346 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 FSHRP23945 695 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 CTNNB1P35222 781 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SOAT1P35610 550 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 MAP2K4P45985 399 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 GPR1P46091 355 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ASMTP46597 345 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 DGKGP49619 791 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PRIM2P49643 509 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 KCNC3Q14003 757 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 NPTX1Q15818 432 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 LIPIQ6XZB0 460 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PLPP6Q8IY26 295 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 WDR20Q8TBZ3 569 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 APOL4Q9BPW4 351 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TOR1BO14657 336 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SH3BP5O60239 455 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PRMT3O60678 531 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TNFRSF1BP20333 461 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 FPR1P21462 350 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 MTAPQ13126 283 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ATP1A4Q13733 1029 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TUBA3CQ13748 450 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 DMC1Q14565 340 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 CACUL1Q86Y37 369 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PTOV1Q86YD1 416 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 NAGSQ8N159 534 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 OR52J3Q8NH60 311 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 FNDC8Q8TC99 324 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 GLMNQ92990 594 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 BORCS5Q969J3 196 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 RAD18Q9NS91 495 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 CDH7Q9ULB5 785 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.3□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 CARNS1A5YM72 827 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 WASH3PC4AMC7 463 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 HTR1AP08908 422 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 GPX2P18283 190 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 EPHA2P29317 976 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 METAP1P53582 386 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TBPL1P62380 186 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 MC1RQ01726 317 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 OCA2Q04671 838 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 C2orf80Q0P641 193 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 GPR153Q6NV75 609 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ZNF480Q8WV37 535 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 STARD8Q92502 1023 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 UBE2FQ969M7 185 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 DOK1Q99704 481 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 H0YIV9 168 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 M0R3G1 203 aa7.29□□□□□ -1.24
NLRC4-204ENST00000404025 UGDHO60701 494 aa7.29□□□□□ -1.24
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