RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csf1P07141 552 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cct3P80318 545 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp759Q7M6X3 721 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zswim5Q80TC6 1188 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dppa5aQ9CQS7 118 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ap3s1Q9DCR2 193 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plek2Q9WV52 353 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adam15O88839 864 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lcmt2Q8BYR1 686 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr158Q8C419 1200 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sox2P48432 319 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EnsaP60840 121 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adra1bP97717 514 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr699Q7TRN3 316 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kctd13Q8BGV7 329 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Npsr1Q8BZP8 371 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem259Q8CIV2 574 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AvenQ9D9K3 342 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IL36RNQ9QYY1 156 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ly6iQ9WU67 134 aa17■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pih1d3Q3KNI6 218 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 StradaQ3UUJ4 431 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psd4Q8BLR5 1005 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8CDN1 933 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cers5Q9D6K9 414 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hbb-bh2B2RVB7 147 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan4bE9Q3G0 505 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 UncxO08934 530 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fgf1P61148 155 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ctps2P70303 586 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lpar5Q149R9 372 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Six3Q62233 333 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EndovQ8C9A2 338 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pdzk1Q9JIL4 519 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 StacP97306 403 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GnrhrQ01776 327 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr174Q3U507 335 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Muc19Q6JHY2 733 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mterf4Q8BVN4 346 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bace2Q9JL18 514 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r238E9Q373 306 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc74aE9Q9U8 364 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp605E9QAH2 694 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grk6O70293 576 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbxas1P36423 533 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Epb41P48193 858 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsd11b1P50172 292 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hcrtr2P58308 460 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr15Q0VDU3 360 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9CQC3 228 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trappc6bQ9D289 158 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gal3st2cQ3ULK5 396 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SynaQ5G5D5 617 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf750Q8BH05 703 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Izumo2Q9DA16 220 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700018B08RikQ9DA83 213 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Xpr1Q9Z0U0 695 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myh2G3UW82 1942 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Foxn2E9Q7L6 429 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sp100O35892 482 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem65Q4VAE3 234 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grxcr1Q50H32 290 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mkrn3Q60764 544 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r114E9Q281 856 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Laptm5Q61168 261 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tpgs1Q99MS8 303 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem138Q9D6G5 162 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Npy2rP97295 381 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cxcr5Q04683 374 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fezf1Q0VDQ9 475 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ClpbQ60649 677 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ZyxQ62523 564 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsfy2Q80Y37 392 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp43Q8BUM9 1132 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erlec1Q8VEH8 483 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr677Q8VF06 312 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr643Q8VGY1 314 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sacm1lQ9EP69 587 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DguokQ9QX60 277 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rhox2cA2AWL9 191 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kbtbd6E9PYD7 486 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm2056J3QQ02 144 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nxpe4Q52KP5 543 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spin1Q61142 262 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpat4Q8K2C8 456 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adgrg3Q8R0T6 542 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Asb8Q91ZT9 288 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rab11fip2G3XA57 512 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp791Q497V9 528 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smco1Q8CEZ1 214 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms