Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULK5

Gal3st2c, Galactose-3-O-sulfotransferase 2C, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st2cQ3ULK5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Gal3st2cQ3ULK5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gal3st2cQ3ULK5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gal3st2cQ3ULK5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gal3st2cQ3ULK5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gal3st2cQ3ULK5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gal3st2cQ3ULK5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gal3st2cQ3ULK5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gal3st2cQ3ULK5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gal3st2cQ3ULK5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gal3st2cQ3ULK5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gal3st2cQ3ULK5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gal3st2cQ3ULK5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gal3st2cQ3ULK5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gal3st2cQ3ULK5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gal3st2cQ3ULK5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gal3st2cQ3ULK5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gal3st2cQ3ULK5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gal3st2cQ3ULK5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gal3st2cQ3ULK5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gal3st2cQ3ULK5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gal3st2cQ3ULK5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gal3st2cQ3ULK5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gal3st2cQ3ULK5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gal3st2cQ3ULK5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gal3st2cQ3ULK5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gal3st2cQ3ULK5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gal3st2cQ3ULK5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gal3st2cQ3ULK5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gal3st2cQ3ULK5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gal3st2cQ3ULK5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gal3st2cQ3ULK5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gal3st2cQ3ULK5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gal3st2cQ3ULK5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gal3st2cQ3ULK5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gal3st2cQ3ULK5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gal3st2cQ3ULK5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gal3st2cQ3ULK5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gal3st2cQ3ULK5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gal3st2cQ3ULK5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gal3st2cQ3ULK5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gal3st2cQ3ULK5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gal3st2cQ3ULK5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gal3st2cQ3ULK5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gal3st2cQ3ULK5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gal3st2cQ3ULK5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gal3st2cQ3ULK5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gal3st2cQ3ULK5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gal3st2cQ3ULK5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gal3st2cQ3ULK5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gal3st2cQ3ULK5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gal3st2cQ3ULK5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gal3st2cQ3ULK5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gal3st2cQ3ULK5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gal3st2cQ3ULK5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gal3st2cQ3ULK5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gal3st2cQ3ULK5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gal3st2cQ3ULK5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gal3st2cQ3ULK5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gal3st2cQ3ULK5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gal3st2cQ3ULK5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gal3st2cQ3ULK5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gal3st2cQ3ULK5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gal3st2cQ3ULK5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gal3st2cQ3ULK5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gal3st2cQ3ULK5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gal3st2cQ3ULK5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gal3st2cQ3ULK5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gal3st2cQ3ULK5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gal3st2cQ3ULK5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gal3st2cQ3ULK5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gal3st2cQ3ULK5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gal3st2cQ3ULK5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gal3st2cQ3ULK5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gal3st2cQ3ULK5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gal3st2cQ3ULK5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gal3st2cQ3ULK5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gal3st2cQ3ULK5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gal3st2cQ3ULK5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gal3st2cQ3ULK5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gal3st2cQ3ULK5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gal3st2cQ3ULK5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gal3st2cQ3ULK5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gal3st2cQ3ULK5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gal3st2cQ3ULK5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gal3st2cQ3ULK5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gal3st2cQ3ULK5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gal3st2cQ3ULK5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gal3st2cQ3ULK5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gal3st2cQ3ULK5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gal3st2cQ3ULK5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gal3st2cQ3ULK5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gal3st2cQ3ULK5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gal3st2cQ3ULK5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms