RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638417.1

MYCN-202, Transcript of MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MYCN, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCN-202ENST00000638417 CDH1P12830 882 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 HNF4AP41235 474 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 NEK2P51955 445 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 C17orf64Q86WR6 236 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 STON2Q8WXE9 905 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 MARK4Q96L34 752 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 SAR1AQ9NR31 198 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 VPS4BO75351 444 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 UBOX5O94941 541 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 PDYNP01213 254 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 MYF5P13349 255 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 HHEXQ03014 270 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 PCDH1Q08174 1060 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CYP4F3Q08477 520 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 TBCCQ15814 346 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ATG9BQ674R7 924 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 OR2T11Q8NH01 316 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CATSPER2Q96P56 530 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CCT7Q99832 543 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ISM1B1AKI9 464 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 LMO7DNF2Z398 122 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 BTN3A3O00478 584 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 UBDO15205 165 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CKMT2P17540 419 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CASP2P42575 452 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 DAB2P98082 770 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 IMPG1Q17R60 797 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 GALNTL6Q49A17 601 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 XKR7Q5GH72 579 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 HES3Q5TGS1 186 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 FRG2Q64ET8 278 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ICE2Q659A1 982 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 Q6ZSR9 355 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 USP7Q93009 1102 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 FRG2BQ96QU4 278 aa14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MYCN-202ENST00000638417 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 CHD6Q8TD26 2715 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 OR6C74A6NCV1 312 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 H7BY64 318 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 SLC28A1O00337 649 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 KIAA0754O94854 1291 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 PCNAP12004 261 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 LBPP18428 481 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 HMGCS1Q01581 520 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 BIRC2Q13490 618 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 CAMK2BQ13554 666 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 NR6A1Q15406 480 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 PROX2Q3B8N5 592 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 MED27Q6P2C8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 HOMEZQ8IX15 550 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 RNF175Q8N4F7 328 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 ARL14Q8N4G2 192 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 OR4C6Q8NH72 309 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 OR10G6Q8NH81 332 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 WDR34Q96EX3 536 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 EHD1Q9H4M9 534 aa14.64□□□□□ -0.07
MYCN-202ENST00000638417 RAXQ9Y2V3 346 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms