RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF773Q6PK81 442 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XKR5Q6UX68 686 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPA6Q8N4T0 437 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HERVK_113Q902F9 699 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ISOC1Q96CN7 298 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ING2Q9H160 280 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NFATC1O95644 943 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QCP02747 245 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMG1P04279 462 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C6P13671 934 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.142e-15■■■■□ 23.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VIPR2P41587 438 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR1P46091 355 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC6A11P48066 632 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PMS2P3Q13401 168 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAB4Q2WGN9 574 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPTPQ5TA50 214 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTOV1Q86YD1 416 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COQ8BQ96D53 544 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DOK1Q99704 481 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SGPP1Q9BX95 441 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2AG1Q9H205 316 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GABRR3A8MPY1 467 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 K7ESM1 405 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E2F6O75461 281 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAPLNO95428 1278 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RB1P06400 928 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-EP13747 358 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADRB3P13945 408 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPPBP16860 134 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDELR2P33947 212 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIGAP37287 484 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTBSQ01459 385 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNAB2Q13303 367 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VEZF1Q14119 521 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB39AQ14964 217 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM74Q86UV6 250 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAS2Q8IYD9 372 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL10Q8N8L6 244 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EHD1Q9H4M9 534 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR34Q9UPC5 381 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1orf226A1L170 272 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC16A6O15403 523 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HS6ST1O60243 411 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IDSP22304 550 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRHBPP24387 322 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCKP27707 260 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HPCAL1P37235 193 aa15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL18R1Q13478 541 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms