RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 SERPINI2O75830 405 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PDE9AO76083 593 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 COL1A2P08123 1366 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 HOXC5Q00444 222 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 GPR50Q13585 617 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 CHPFQ8IZ52 775 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 CTPS1P17812 591 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PRIM2P49643 509 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 SLC14A1Q13336 389 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 FBXO43Q4G163 708 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 LGI4Q8N135 537 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 STK40Q8N2I9 435 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 COPS8Q99627 209 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 HDHD2Q9H0R4 259 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 NMUR1Q9HB89 426 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 SSR3Q9UNL2 185 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 CEP350Q5VT06 3117 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 ARHGAP33O14559 1287 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 OR7A17O14581 309 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 MUSKO15146 869 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 APOL3O95236 402 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 CSNK2BP67870 215 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 FAPQ12884 760 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 RNF121Q9H920 327 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 CLN6Q9NWW5 311 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS2-201ENST00000359276 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 SLC25A27O95847 323 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 NUDT7P0C024 238 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 TATDN3Q17R31 274 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 VMACQ2NL98 169 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 TRIM69Q86WT6 500 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 SERPINB11Q96P15 392 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 ARL15Q9NXU5 204 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 ESR1P03372 595 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 MMP2P08253 660 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 MFSD10Q14728 455 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 VEPH1Q14D04 833 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 CHAC2Q8WUX2 184 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 RLIMQ9NVW2 624 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 LY75O60449 1722 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 BNC1Q01954 994 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 FBXL22Q6P050 247 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 MOB2Q70IA6 237 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 RNF175Q8N4F7 328 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 TCF25Q9BQ70 676 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 SOX14O95416 240 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 IL18Q14116 193 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 CD200R1Q8TD46 325 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 APH1BQ8WW43 257 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 NELL1Q92832 810 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 IGSF8Q969P0 613 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 GABRQQ9UN88 632 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 A0A0D9SEW6 157 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 PLD2O14939 933 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 MYL12BO14950 172 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 PBX3P40426 434 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 RFX2P48378 723 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 CDH18Q13634 790 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS2-201ENST00000359276 MCUBQ9NWR8 336 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms