RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ints6Q6PCM2 883 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efr3aQ8BG67 819 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AW551984Q8BGF0 804 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8BGK9 164 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cfap61Q8CEL2 1252 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf668Q8K2R5 619 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TbccQ8VCN9 341 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r16aQ923M0 524 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcam1Q99NB3 548 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp773Q9CZ29 471 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PlgrktQ9D3P8 147 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tex47Q9D5W8 253 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc6a14Q9JMA9 638 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bdp1Q571C7 2467 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10800D3Z496 220 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smpd2O70572 419 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01807 119 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsta2P10648 222 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CryaaP24622 196 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina3cP29621 417 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem181aQ3U3W2 474 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spire1Q52KF3 598 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rftn1Q6A0D4 554 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HjurpQ6PG16 667 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vac14Q80WQ2 782 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B3galnt2Q8BG28 504 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6377Q8BHV4 303 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SgtaQ8BJU0 315 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Utp4Q8R2N2 686 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhga4Q91XY4 930 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ArhgdiaQ99PT1 204 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ska1Q9CPV1 254 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm14459A2BI73 179 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlgap4B1AZP2 992 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7535F7CXE4 302 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rgs4O08899 205 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Matn3O35701 481 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RabggtbP53612 339 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hpcal1P62748 193 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl2l1Q64373 233 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrg1Q8K209 687 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mapk8Q91Y86 384 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TmlheQ91ZE0 421 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d25A1A5B6 742 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sppl2cA2A6C4 690 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam43bA2AM80 330 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm17019K7N6W5 255 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PbsnO08976 174 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ctnnd2O35927 1247 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GfapP03995 430 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CkmP07310 381 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrps6P58064 125 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NfycP70353 335 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ctps1P70698 591 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp39Q02525 718 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp39Q3TIX9 564 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klra2Q60660 288 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gas6Q61592 674 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galnt7Q80VA0 657 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ikzf5Q8BU00 419 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc49a3Q8CE47 516 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smco1Q8CEZ1 214 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Steap3Q8CI59 488 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1263Q8VG63 306 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uts2rQ8VIH9 385 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ptov1Q91VU8 416 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prps2Q9CS42 318 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf186Q9D241 226 aa20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp383A0A087WRR7 490 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm13089A2AGW7 455 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr742A2RTP5 311 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam46dB1ATX6 390 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mybpc1D3YU50 1127 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spdye4cI6XKQ3 339 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cxcr3O88410 367 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il1aP01582 270 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf703P0CL69 594 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lire1P11260 357 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnks2Q3UES3 1166 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tapt1Q4VBD2 564 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc23a3Q60850 611 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itih5Q8BJD1 952 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tgif2Q8C0Y1 237 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr606Q8VGZ8 319 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SharpinQ91WA6 380 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nipal2Q91WC7 383 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrl4Q923X1 739 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.2 ms