RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 UBQLN3Q9H347 655 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 SPG21Q9NZD8 308 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 FAM149AA5PLN7 773 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 GLCEO94923 617 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 TSHBP01222 138 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 VCLP18206 1134 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 DCTP40126 519 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 OPCMLQ14982 345 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 HERC3Q15034 1050 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 WDR38Q5JTN6 314 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 RNF121Q9H920 327 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 FAM172BPA6NC97 362 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF197O14709 1029 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ATP9AO75110 1047 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 DFFBO76075 338 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 EDN1P05305 212 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH4A1P30038 563 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ERVFC1-1P60608 527 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 GPR17Q13304 367 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KA1Q15418 735 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 TTC27Q6P3X3 843 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD8Q9NX08 183 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 TNNQ9UQP3 1299 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ND3P03897 115 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SP9P0CG40 484 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SSTR1P30872 391 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NME5P56597 212 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NPRL3Q12980 569 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SNX21Q969T3 373 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V0BQ99437 205 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 BICDL2A1A5D9 508 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM30A4D0T7 59 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 EPHB6O15197 1021 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GLRA3O75311 464 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A3O75751 556 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-59P01825 116 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 LHCGRP22888 699 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA3P26006 1051 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CBX3Q13185 183 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 XKR3Q5GH77 459 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRC-212ENST00000491302 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 STPG4Q8N801 248 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AP2M1Q96CW1 435 aa6.95□□□□□ -1.3
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