RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 CDH20Q9HBT6 801 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ATP8B3O60423 1300 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CAVIN2O95810 425 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ALPPP05187 535 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CSN3P07498 182 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ALPPL2P10696 532 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 EPORP19235 508 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CCNA2P20248 432 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PTGER4P35408 488 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MNDAP41218 407 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CDH11P55287 796 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MAPK11Q15759 364 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CA9Q16790 459 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TCTE1Q5JU00 501 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TMEM139Q8IV31 216 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SFRP1Q8N474 314 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 THAP8Q8NA92 274 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CNNM3Q8NE01 707 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 C5orf30Q96GV9 206 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 NSL1Q96IY1 281 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LMLNQ96KR4 655 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PSD2Q9BQI7 771 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 NYXQ9GZU5 481 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZNF350Q9GZX5 532 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 S1PR5Q9H228 398 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 POLE3Q9NRF9 147 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CYP39A1Q9NYL5 469 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PROCRQ9UNN8 238 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PRSS44E7EML9 344 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 K7EPI3 171 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ST8SIA3O43173 380 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 AP5Z1O43299 807 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LMX1BO60663 402 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SMPD2O60906 423 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 HSF2BPO75031 334 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-204ENST00000489160 AKAP3O75969 853 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PGLSO95336 258 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ACSL3O95573 720 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TSHBP01222 138 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 GH1P01241 217 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 C8orf89P0DMQ9 161 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LIFP15018 202 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PHEXP78562 749 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ODF4Q2M2E3 257 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 WDR38Q5JTN6 314 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DCAF10Q5QP82 559 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TM9SF4Q92544 642 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 NSMAFQ92636 917 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 RAD9AQ99638 391 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 PANK2Q9BZ23 570 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TRIM7Q9C029 511 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LAT2Q9GZY6 243 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 SPG21Q9NZD8 308 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 KIF3AQ9Y496 699 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 DUXAA6NLW8 204 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-204ENST00000489160 TRIM16O95361 564 aa4.55□□□□□ -1.68
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