RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM203Q969S6 136 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RADILQ96JH8 1075 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TCF25Q9BQ70 676 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AMBNQ9NP70 447 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BBOX1O75936 387 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 IFNA6P05013 189 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GOT1P17174 413 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RARRES1P49788 294 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NPRL3Q12980 569 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GRIK5Q16478 980 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SLC7A6Q92536 515 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMED9Q9BVK6 235 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CST11Q9H112 138 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PQ09 198 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PER3P56645 1201 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ACOT1Q86TX2 421 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NELL2Q99435 816 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RREB1Q92766 1687 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SPTBP11277 2137 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SHOXO15266 292 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ORC1Q13415 861 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DOK6Q6PKX4 331 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF35P13682 527 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TYRP14679 529 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ETV6P41212 452 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CDH12P55289 794 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 E2F1Q01094 437 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CCNJQ5T5M9 372 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GPR158Q5T848 1215 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 34.1
SBNO1-202ENST00000420886 HERVK_113Q902F9 699 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CNTN3Q9P232 1028 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF639Q9UID6 485 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RAD17O75943 681 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RAF1P04049 648 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PPP3CBP16298 524 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HTR3AP46098 478 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PON3Q15166 354 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NDUFA9Q16795 377 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZACNQ401N2 412 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CPTPQ5TA50 214 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 COA1Q9GZY4 146 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EXO5Q9H790 373 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.3□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CXCR2P25025 360 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 IVDP26440 423 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PCSK1P29120 753 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PEA15Q15121 130 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.29□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 A8MUA0 341 aa6.29□□□□□ -1.4
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