RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 VNN3Q9NY84 501 aa22.35■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 TIMP2P16035 220 aa22.34■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.34■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 KRT87PA6NCN2 255 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-202ENST00000399409 E7EQ34 232 aa22.33■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 LEFTY1O75610 366 aa22.33■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 RAB15P59190 212 aa22.33■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 RNF175Q8N4F7 328 aa22.33■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.33■■□□□ 1.17
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RABGGTA-202ENST00000399409 FOPNLQ96NB1 174 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 BCL7BQ9BQE9 202 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 PALMDQ9NP74 551 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 TDP1Q9NUW8 608 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.32■■□□□ 1.16
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