RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 VASH2Q86V25 355 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OXR1Q8N573 874 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PAF1Q8N7H5 531 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKFN1Q8N957 763 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7D4Q8NG98 312 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NAT14Q8WUY8 206 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ9Q92806 393 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 ARRDC3Q96B67 414 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 APOLD1Q96LR9 279 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF597Q96LX8 424 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CNBD2Q96M20 576 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF382Q96SR6 550 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 HGH1Q9BTY7 390 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CLPBQ9H078 707 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSS2Q9NR19 701 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 APPL1Q9UKG1 709 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF711Q9Y462 761 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD3Q9Y597 815 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 U3KQA8 63 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PP18 115 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS12A0PJE2 317 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC160A6NGH7 325 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51F1A6NGY5 319 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC154A6NI56 674 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 FBP2O00757 339 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OIP5O43482 229 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP10O43572 662 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK8O60259 260 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A3O75751 556 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CKMT1AP12532 417 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGALP20701 1170 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 DGKAP23743 735 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 HMOX2P30519 316 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIA3P42263 894 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CSNK1DP48730 415 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3CGP48736 1102 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SGSHP51688 502 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PGGT1BP53609 377 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ADPRHP54922 357 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOAP61586 193 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ESRRGP62508 458 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBA4AP68366 448 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 POU4F2Q12837 409 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NFYCQ13952 458 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CST6Q15828 149 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TBR1Q16650 682 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.83□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 IL23RQ5VWK5 629 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 LCN8Q6JVE9 175 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RETSATQ6NUM9 610 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 BORAQ6PGQ7 559 aa6.83□□□□□ -1.32
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