RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gsta4P24472 222 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usf1Q61069 310 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CishQ62225 257 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AgpsQ8C0I1 645 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ift80Q8K057 777 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snrnp27Q8K194 155 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abhd11Q8K4F5 307 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr812Q8VG64 310 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DptQ9QZZ6 201 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lhx9Q9WUH2 397 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sema4gQ9WUH7 837 aa21.82■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mup6A2AV72 179 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc13D3YV10 709 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr620E9PZ66 313 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr741L7N1Y5 311 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab10P61027 200 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbx6P70327 436 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Treml4Q3LRV9 263 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc10a7Q5PT53 340 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Repin1Q5U4E2 545 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il12rb1Q60837 738 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Birc2Q62210 612 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Doc2aQ7TNF0 405 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc186Q8C9S4 917 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr582Q8VGV9 319 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx15Q91WE1 337 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhdc8aQ91XA8 350 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abhd17aQ99JW1 310 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prelid3bQ9CYY7 195 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lypd2Q9DD23 127 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akr1c12Q9JLI0 323 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ItgaxQ9QXH4 1169 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lbx2Q9WUN8 195 aa21.81■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bfsp1A2AMT1 669 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zmynd12A2BGJ5 363 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smpd5D6MZJ6 483 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apol11bE9PUZ0 337 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp229E9PWT2 705 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Man2b2O54782 1018 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnk4O88454 398 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp60P16374 707 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FesP16879 822 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbpl1P62340 186 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina3mQ03734 418 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prmt9Q3U3W5 846 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap17Q3UIA2 846 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RalyQ64012 312 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Htr1aQ64264 421 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Txndc15Q6P6J9 344 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aph1bQ8C7N7 257 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Capn8Q91VA3 703 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa21.8■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacna1aP97445 2368 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm29554A0A087WNW4 188 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhl4B1AZR0 717 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kifc5bE9PUA5 672 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ceacam3E9Q6J4 706 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HgdO09173 445 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kpna4O35343 521 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif5aP33175 1027 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Emp1P47801 160 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KapP61110 121 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc74bQ14BP6 391 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ffar3Q3UFD7 319 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc58Q3UGP9 366 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dtx3lQ3UIR3 748 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xrcc1Q60596 631 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St8sia1Q64687 355 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc8eQ66JT1 795 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tvp23aQ6NVH0 222 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ckap2lQ7TS74 745 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Samd14Q8K070 417 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1311Q8VET0 312 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr690Q8VH18 315 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gps2Q921N8 327 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TympQ99N42 471 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tsnaxip1Q99P25 704 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nudt22Q9DD16 308 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HrgQ9ESB3 525 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jam2Q9JI59 298 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa21.79■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinb3cA2RSF9 386 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acbd4E9Q289 327 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EllO08856 602 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stam2O88811 523 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scg5P12961 212 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MagP20917 626 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LumP51885 338 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adad1Q5SUE7 619 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnfrsf8Q60846 498 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 XiapQ60989 496 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defa17Q64016 82 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms