Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD16

Nudt22, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 22, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt22Q9DD16 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Nudt22Q9DD16 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nudt22Q9DD16 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nudt22Q9DD16 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Nudt22Q9DD16 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nudt22Q9DD16 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Nudt22Q9DD16 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Nudt22Q9DD16 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nudt22Q9DD16 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nudt22Q9DD16 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nudt22Q9DD16 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nudt22Q9DD16 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nudt22Q9DD16 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Nudt22Q9DD16 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nudt22Q9DD16 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nudt22Q9DD16 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nudt22Q9DD16 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nudt22Q9DD16 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nudt22Q9DD16 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Nudt22Q9DD16 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nudt22Q9DD16 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nudt22Q9DD16 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nudt22Q9DD16 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nudt22Q9DD16 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nudt22Q9DD16 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nudt22Q9DD16 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nudt22Q9DD16 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nudt22Q9DD16 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nudt22Q9DD16 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nudt22Q9DD16 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nudt22Q9DD16 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nudt22Q9DD16 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nudt22Q9DD16 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nudt22Q9DD16 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nudt22Q9DD16 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nudt22Q9DD16 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nudt22Q9DD16 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nudt22Q9DD16 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nudt22Q9DD16 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nudt22Q9DD16 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nudt22Q9DD16 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nudt22Q9DD16 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nudt22Q9DD16 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nudt22Q9DD16 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nudt22Q9DD16 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nudt22Q9DD16 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nudt22Q9DD16 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nudt22Q9DD16 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nudt22Q9DD16 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nudt22Q9DD16 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nudt22Q9DD16 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nudt22Q9DD16 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nudt22Q9DD16 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nudt22Q9DD16 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nudt22Q9DD16 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nudt22Q9DD16 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nudt22Q9DD16 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nudt22Q9DD16 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nudt22Q9DD16 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nudt22Q9DD16 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nudt22Q9DD16 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nudt22Q9DD16 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nudt22Q9DD16 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nudt22Q9DD16 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nudt22Q9DD16 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nudt22Q9DD16 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nudt22Q9DD16 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nudt22Q9DD16 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nudt22Q9DD16 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nudt22Q9DD16 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nudt22Q9DD16 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nudt22Q9DD16 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nudt22Q9DD16 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nudt22Q9DD16 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nudt22Q9DD16 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nudt22Q9DD16 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nudt22Q9DD16 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nudt22Q9DD16 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nudt22Q9DD16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nudt22Q9DD16 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nudt22Q9DD16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nudt22Q9DD16 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nudt22Q9DD16 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nudt22Q9DD16 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nudt22Q9DD16 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nudt22Q9DD16 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nudt22Q9DD16 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nudt22Q9DD16 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nudt22Q9DD16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nudt22Q9DD16 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nudt22Q9DD16 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nudt22Q9DD16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nudt22Q9DD16 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nudt22Q9DD16 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nudt22Q9DD16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nudt22Q9DD16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nudt22Q9DD16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nudt22Q9DD16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nudt22Q9DD16 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nudt22Q9DD16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms