RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 FDXRP22570 491 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 EMP2P54851 167 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 DSG2Q14126 1118 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 CCNG2Q16589 344 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 MRNIPQ6NTE8 343 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 MFSD3Q96ES6 412 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 MVB12AQ96EY5 273 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 SYNPO2LQ9H987 977 aa23.72■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 APCP25054 2843 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GUH1 482 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 DYTNA2CJ06 578 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 IDSB3KWA1 339 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 PHF2O75151 1096 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 JRKO75564 520 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 C4orf22Q6V702 233 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM136AQ96C01 138 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 TCF12Q99081 682 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 TRPC4Q9UBN4 977 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 ENTPD4Q9Y227 616 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF33A8MVX0 844 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 H3BMM5 538 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MYO1CO00159 1063 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.387e-7■■■□□ 16.8
PTPRF-216ENST00000617451 VPS26AO75436 327 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ESR1P03372 595 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CXCR2P25025 360 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MGAT1P26572 445 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A3P40879 764 aa23.7■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CES3Q6UWW8 571 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 FJX1Q86VR8 437 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PAQR7Q86WK9 346 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1A1LQ8N752 337 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TAAR6Q96RI8 345 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SYBUQ9NX95 663 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 GALPQ9UBC7 116 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV17A0A0B4J275 112 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 PCDH17O14917 1159 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 GPR42O15529 346 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 BMP10O95393 424 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF8P28908 595 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 TDGF1P3P51864 188 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 GARNL3Q5VVW2 1013 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SIRT6Q8N6T7 355 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 AMER3Q8N944 861 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 OR2A5Q96R48 311 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 CHRM3P20309 590 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF425Q6IV72 752 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 RELTQ969Z4 430 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MARVELD3Q96A59 401 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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