RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	EBLN1	P0CF75	366 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GABRG2	P18507	467 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DCK	P27707	260 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPK9	P45984	424 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PIK3CG	P48736	1102 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP4B	P51164	291 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GK3P	Q14409	553 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	IL23R	Q5VWK5	629 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OGFOD2	Q6N063	350 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318		Q6ZS52	159 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM124A	Q86V42	546 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PKP2	Q99959	881 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf50	Q9BV19	199 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FZD3	Q9NPG1	666 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OLAH	Q9NV23	265 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	VPS4B	O75351	444 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR47	O94967	919 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ALOX5	P09917	674 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HGF	P14210	728 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LBP	P18428	481 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	IMPA1	P29218	277 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ACSL1	P33121	698 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TPMT	P51580	245 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LILRA2	Q8N149	483 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX31	Q8N9S9	440 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GUCD1	Q96NT3	240 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PKP4	Q99569	1192 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MRGBP	Q9NV56	204 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		14.92	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	C10orf142	B7Z368	130 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC16A8	O95907	504 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GPX3	P22352	226 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PAOX	Q6QHF9	649 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	AMZ2	Q86W34	360 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ASB12	Q8WXK4	309 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FOPNL	Q96NB1	174 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HBEGF	Q99075	208 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PSD2	Q9BQI7	771 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	C8orf4	Q9NR00	106 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		14.91	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR89B	P0CG08	455 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CHRNB1	P11230	501 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ACADM	P11310	421 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	IL9	P15248	144 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ITPKA	P23677	461 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RXRG	P48443	463 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TFF2	Q03403	129 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RPA4	Q13156	261 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GK5	Q6ZS86	529 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		14.9	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SFRP1	Q8N474	314 aa		14.9	□□□□□ -0.02

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