RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 DSG2Q14126 1118 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SLMAPQ14BN4 828 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TMED2Q15363 201 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM153CQ494X1 144 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TTC23LQ6PF05 361 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SBSNQ6UWP8 590 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CNPY4Q8N129 248 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 IL17FQ96PD4 163 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 EPN3Q9H201 632 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 RAB21Q9UL25 225 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NFU1Q9UMS0 254 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NFS1Q9Y697 457 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PTPN13Q12923 2485 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ARGFXA6NJG6 315 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 C9J4A7 227 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RASGRF2O14827 1237 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 VPS26AO75436 327 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PIAS1O75925 651 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PDGFAP04085 211 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MAGP20916 626 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CCL11P51671 97 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CDKL1Q00532 357 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RELAQ04206 551 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CHAF1BQ13112 559 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NCF4Q15080 339 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 COLEC12Q5KU26 742 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 GRTP1Q5TC63 336 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CPZQ66K79 652 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CEP97Q8IW35 865 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PALM2Q8IXS6 379 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX19Q8NA77 164 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 FBF1Q8TES7 1133 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MZB1Q8WU39 189 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CDKL2Q92772 493 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 GBP5Q96PP8 586 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CYTH2Q99418 400 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NDNQ99608 321 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DERL2Q9GZP9 239 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ING2Q9H160 280 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ACSS2Q9NR19 701 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms