RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCTD6Q8NC69 237 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01560Q8TB33 94 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PERPQ96FX8 193 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf90Q96M02 699 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL17FQ96PD4 163 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COPS8Q99627 209 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.6□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLG2Q9UHN1 485 aa9.6□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP99D6REC4 459 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDC80O14777 642 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA5P08758 320 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC5A8Q8N695 610 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMER3Q8N944 861 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC13O75165 2243 aa9.59□□□□□ -0.87
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITGA8P53708 1063 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FIGNQ5HY92 759 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KAZNQ674X7 775 aa9.58□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PQLC3Q8N755 202 aa9.58□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HACD3Q9P035 362 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCINQ9Y6U3 715 aa9.58□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCN2AQ99250 2005 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM166BA8MTA8 275 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.882e-10■■□□□ 13.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.881e-7■□□□□ 8.7
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP2A1O95782 977 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS56P0CW18 603 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPXP11678 715 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD9P21926 228 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BMP5P22003 454 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMB5P28074 263 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKLRP30613 574 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX19P40855 299 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC26A3P40879 764 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HKDC1Q2TB90 917 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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