RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 UPK3BL2E5RIL1 263 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FKBP9O95302 570 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MT-ND2P03891 347 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PRPS1L1P21108 318 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ST13P50502 369 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MTAPQ13126 283 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HORMAD1Q86X24 394 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF175Q8N4F7 328 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ASB11Q8WXH4 323 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 NELL1Q92832 810 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2FQ969M7 185 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 EBPLQ9BY08 206 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS6KA6Q9UK32 745 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 YIPF1Q9Y548 306 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PQY0 241 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ABLIM3O94929 683 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 LATS1O95835 1130 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FADS2O95864 444 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 GPX2P18283 190 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC6A12P48065 614 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 CSNK1DP48730 415 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 IFITM3Q01628 133 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TCTN1Q2MV58 587 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC66Q68CR7 880 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ZZZ3Q8IYH5 903 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TCAIMQ8N3R3 496 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT87PA6NCN2 255 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SEMG1P04279 462 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINA4P29622 427 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 HNMTP50135 292 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ACOT13Q9NPJ3 140 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 RASSF1Q9NS23 344 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC4EQ9ULY5 219 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TET1Q8NFU7 2136 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 RGS10O43665 173 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 NCS1P62166 190 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PTSQ03393 145 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 RFLNAQ6ZTI6 216 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 VRK3Q8IV63 474 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ATG16L2Q8NAA4 619 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 LYSMD1Q96S90 227 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO8Q9NRD0 319 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 INIPQ9NRY2 104 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT84Q9NSB2 600 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 NPIPB8E9PQR5 432 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXA2O43364 376 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SCN2BO60939 215 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 EPN2O95208 641 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ITPKAP23677 461 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEA8P43361 318 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINB10P48595 397 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 UGT8Q16880 541 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP2U1Q7Z449 544 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PTOV1Q86YD1 416 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SCRN2Q96FV2 425 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 HSH2DQ96JZ2 352 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM221A6NGB7 291 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEB17A8MXT2 336 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 EFEMP2O95967 443 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 IGSF6O95976 241 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 C8GP07360 202 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 OR56A5P0C7T3 313 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PCSK2P16519 638 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PTPN5P54829 565 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 INAQ16352 499 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ADCK1Q86TW2 530 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SYT12Q8IV01 421 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 MFSD4AQ8N468 514 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 KIF17Q9P2E2 1029 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 HALP42357 657 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP3CCP48454 512 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 WNT3P56703 355 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ABRQ12979 859 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 VEPH1Q14D04 833 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM236Q5W0B7 351 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TXNDC8Q6A555 127 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 Q6ZNB5 142 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ATAD3AQ9NVI7 634 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM20BO75063 409 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 BMP4P12644 408 aa26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms