RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPAN6O43657 245 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CBFA2T3O75081 653 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC42P60953 191 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 YBX1P67809 324 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.423e-7■■■■□ 25.6
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RABGEF1-211ENST00000503687 DGKKQ5KSL6 1271 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 H3BMQ9 156 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 SERPINI2O75830 405 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 BMP10O95393 424 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 SHMT2P34897 504 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 MGAT3Q09327 533 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF846Q147U1 533 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 OARD1Q9Y530 152 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 LEFTY1O75610 366 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 TAMM41Q96BW9 452 aa12.42□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00597Q9H2U6 94 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 SMIM30A4D0T7 59 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 LEFTY2O00292 366 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 LSM1O15116 133 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
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RABGEF1-211ENST00000503687 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 OR7A17O14581 309 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNDBP1O95273 360 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 SOD2P04179 222 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CSF2RAP15509 400 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-211ENST00000503687 CCR7P32248 378 aa12.4□□□□□ -0.42
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