RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SUSD4Q5VX71 490 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 FAM166AQ6J272 317 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 BTNL8Q6UX41 500 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD9Q7L273 389 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 APCDD1Q8J025 514 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC63Q8NA47 563 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MGARPQ8TDB4 240 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PSD2Q9BQI7 771 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 CTDSPLO15194 276 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V0E1O15342 81 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 KINO60870 393 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 SERPING1P05155 500 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 TGFB3P10600 412 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 GP1BBP13224 206 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 NR1D1P20393 614 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 GLIPR1P48060 266 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GUV1 79 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 STMN1P16949 149 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-212ENST00000491302 CD27P26842 260 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRC-212ENST00000491302 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.99□□□□□ -1.29
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