RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.15□□□□□ -0.62
USP11-208ENST00000480104 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.15□□□□□ -0.62
USP11-208ENST00000480104 ROS1P08922 2347 aa11.15□□□□□ -0.62
USP11-208ENST00000480104 OR14I1A6ND48 311 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 DVL2O14641 736 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 CTSVO60911 334 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 GFPT2O94808 682 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 NAXEQ8NCW5 288 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 TRIM7Q9C029 511 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 MMP25Q9NPA2 562 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.14□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 HSPB2A8KAH6 182 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 FAM166BA8MTA8 275 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 NDC80O14777 642 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 WDR1O75083 606 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 FPR1P21462 350 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 HSPB2Q16082 182 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 EXT1Q16394 746 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 ACKR1Q16570 336 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 SYT16Q17RD7 645 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 MEIOBQ8N635 442 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 PPM1NQ8N819 430 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 M1APQ8TC57 530 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 FATE1Q969F0 183 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 CNPPD1Q9BV87 410 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.13□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.13□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 QSOX1O00391 747 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 SLC16A5O15375 505 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 IL1R2P27930 398 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 SOX18P35713 384 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 SLC26A3P40879 764 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 TAS2R50P59544 299 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 NOMO1Q15155 1222 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 HSPH1Q92598 858 aa11.12□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 CABS1Q96KC9 395 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 STK33Q9BYT3 514 aa11.12□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.12□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.12□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 CR1P17927 2039 aa11.11□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 CCNCP24863 283 aa11.11□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 THBS2P35442 1172 aa11.11□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 HLCSP50747 726 aa11.11□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 DEFA6Q01524 100 aa11.11□□□□□ -0.63
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USP11-208ENST00000480104 VEZF1Q14119 521 aa11.11□□□□□ -0.63
USP11-208ENST00000480104 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
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