RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 PAK5Q9P286 719 aa21.53■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 MYO7BQ6PIF6 2116 aa21.53■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 POLQO75417 2590 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 IDSB3KWA1 339 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 FFAR3O14843 346 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 PCDH17O14917 1159 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 GPR42O15529 346 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 SERPINA7P05543 415 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 ERVK-10P10266 1014 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 FDXRP22570 491 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 NMBRP28336 390 aa21.52■■□□□ 1.04
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USP4-208ENST00000464168 GBX1Q14549 363 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 SIRT6Q8N6T7 355 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 CCDC89Q8N998 374 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 NR4A3Q92570 626 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 CABS1Q96KC9 395 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.52■■□□□ 1.04
USP4-208ENST00000464168 TRAV17A0A0B4J275 112 aa21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 ERGP11308 486 aa21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 ARNTP27540 789 aa21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 NAA25Q14CX7 972 aa21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 AMER3Q8N944 861 aa21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.51■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 TACC2O95359 2948 aa21.51■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 PRSS44E7EML9 344 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 BMP10O95393 424 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 CELA2AP08217 269 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 CXCR2P25025 360 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 FMO4P31512 558 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 SLC26A3P40879 764 aa21.5■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 PAQR7Q86WK9 346 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 OR9A1PQ8NGU1 263 aa21.5■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 SMPDL3AQ92484 453 aa21.5■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 IL22Q9GZX6 179 aa21.5■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.49■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 NIPSNAP2O75323 286 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 VAPBO95292 243 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 F10P00742 488 aa21.49■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 AMER2Q8N7J2 671 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 FAM136AQ96C01 138 aa21.49■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 OR2A5Q96R48 311 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 TGIF2Q9GZN2 237 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 C14orf105Q9NVL8 296 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 BFARQ9NZS9 450 aa21.49■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 GALPQ9UBC7 116 aa21.49■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa21.48■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 WFS1O76024 890 aa21.48■■□□□ 1.03
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USP4-208ENST00000464168 HEXBP07686 556 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 ZNF425Q6IV72 752 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 GFRALQ6UXV0 394 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 KIFC1Q9BW19 673 aa21.48■■□□□ 1.03
USP4-208ENST00000464168 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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