RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYBRD1Q53TN4 286 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR149Q86SP6 731 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP206Q8IYR0 622 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HM13Q8TCT9 377 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NELL1Q92832 810 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMBIM1Q969X1 311 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXL20Q96IG2 436 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM245Q9H330 911 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGK2Q9HBY8 427 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH23Q9H251 3354 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL4A3Q01955 1670 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND4AQ7Z401 1863 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMP20O60882 483 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD3B1P14060 373 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETS2P15036 469 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD3B2P26439 372 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPGP40121 348 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTHFRP42898 656 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT8Q16880 541 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADNP2Q6IQ32 1131 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHRSXQ8N5I4 330 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF13Q92913 245 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCLNQ969V3 563 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRF2Q9HAW0 419 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FADS3Q9Y5Q0 445 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VILLO15195 856 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREG1O75629 220 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNAP29O95721 258 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPTQ07507 201 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSM2AQ08AH3 577 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PON2Q15165 354 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSM2BQ68CK6 577 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XKR5Q6UX68 686 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF480Q8WV37 535 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKD3O94806 890 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETHE1O95571 254 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIC3O95833 236 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD18Q0P651 414 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC14A1Q13336 389 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E2F2Q14209 437 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD21Q4G0X4 260 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TERB1Q8NA31 727 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7G3Q8NG95 312 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEIL2Q969S2 332 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN10Q9UBB4 475 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNE2Q9Y6J6 123 aa18.1■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCN2BO60939 215 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAPLNO95428 1278 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPC1P48995 793 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARSFP54793 590 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNT3P56703 355 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C21orf58P58505 322 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBPL1P62380 186 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYTL1Q8IYJ3 562 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF786Q8N393 782 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8J2Q8NGG1 315 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NETO1Q8TDF5 533 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM39Q9HCM9 518 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DYRK4Q9NR20 520 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB9Q9UBS3 223 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf42Q9H799 3197 aa18.09■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX7A2P14406 83 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FSHRP23945 695 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH3A2P51648 485 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBA4AP68366 448 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms