RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	RPN2	P04844	631 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	AGXT	P21549	392 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CD9	P21926	228 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	OTX2	P32243	289 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CASR	P41180	1078 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MLLT10	P55197	1068 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CDK16	Q00536	496 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	KLRB1	Q12918	225 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	KIR2DS3	Q14952	304 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ZBTB2	Q8N680	514 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	THAP4	Q8WY91	577 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	LPGAT1	Q92604	370 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ING2	Q9H160	280 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MASP2	O00187	686 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	AP3B1	O00203	1094 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RASGRF2	O14827	1237 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF185	O15231	689 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	C1orf105	O95561	183 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	HBQ1	P09105	142 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MCM3	P25205	808 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PSMB5	P28074	263 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RAPSN	Q13702	412 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	FCRL6	Q6DN72	434 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	LRRC6	Q86X45	466 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SLC35F6	Q8N357	371 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PBK	Q96KB5	322 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	BIRC8	Q96P09	236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RELN	P78509	3460 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	NRP2	O60462	931 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CHRM3	P20309	590 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	MAGEA6	P43360	314 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	PGD	P52209	483 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	TTC23L	Q6PF05	361 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	CENPU	Q71F23	418 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		10	□□□□□ -0.81
PSME2-208	ENST00000559359	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms