RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529895.1

BBS1-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 560 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-216ENST00000529895 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TMEM74Q96NL1 305 aa14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.7□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.7□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ZIC1Q15915 447 aa14.69□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.69□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.69□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 K7EPI3 171 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 STX16O14662 325 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ATP8B1O43520 1251 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CCNDBP1O95273 360 aa14.68□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 PRKAA2P54646 552 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ABATP80404 500 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 C17orf64Q86WR6 236 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CARFQ8N187 725 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SNX31Q8N9S9 440 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 RDH11Q8TC12 318 aa14.68□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 COPG2Q9UBF2 871 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.68□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 CDH1P12830 882 aa14.67□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 CDC16Q13042 620 aa14.67□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.67□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 NEIL2Q969S2 332 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 STRADBQ9C0K7 418 aa14.67□□□□□ -0.06
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BBS1-216ENST00000529895 OPTCQ9UBM4 332 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.67□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 PCM1Q15154 2024 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TMEM120BA0PK00 339 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 E2F3O00716 465 aa14.66□□□□□ -0.06
BBS1-216ENST00000529895 TM9SF1O15321 606 aa14.66□□□□□ -0.06
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