RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 MT-ND4LP03901 98 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GSTM3P21266 225 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HPCAL1P37235 193 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNMA1Q8ND90 353 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KAT5Q92993 513 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL22Q9GZX6 179 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C1GALT1Q9NS00 363 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADAMTS12P58397 1594 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AP2A1O95782 977 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HLA-DOAP06340 250 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERVK-10P10266 1014 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATF3P18847 181 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DTYMKP23919 212 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARID5AQ03989 594 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPA1Q15181 289 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GUK1Q16774 197 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CFAP161Q6P656 301 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HID1Q8IV36 788 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXL6Q8N531 539 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DBF4BQ8NFT6 615 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR2L2Q8NH16 312 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ASB12Q8WXK4 309 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HGDQ93099 445 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LGALS12Q96DT0 336 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRCH3Q96II8 777 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NEURL2Q9BR09 285 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MFFQ9GZY8 342 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GKN1Q9NS71 199 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DKKL1Q9UK85 242 aa3.37□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TAAR5O14804 337 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 P2RX6O15547 441 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYP26A1O43174 497 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 BEST1O76090 585 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HEXAP06865 529 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MC3RP41968 323 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKAG1P54619 331 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HERVK_113P62684 666 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPS1Q13098 491 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GAS6Q14393 721 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NR6A1Q15406 480 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SEC23BQ15437 767 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LCN8Q6JVE9 175 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR8J3Q8NGG0 315 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EDAQ92838 391 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SORT1Q99523 831 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF559Q9BR84 538 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CALN1Q9BXU9 219 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CXorf65A6NEN9 183 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RLN2P04090 185 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PGRP06401 933 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GJB1P08034 283 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CTNNB1P35222 781 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SP140Q13342 867 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHRNA6Q15825 494 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IQCJQ1A5X6 159 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SHFQ7M4L6 423 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM83AQ86UY5 434 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EDEM1Q92611 657 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MTMR8Q96EF0 704 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAD9AQ99638 391 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MINPP1Q9UNW1 487 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GINS2Q9Y248 185 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PROS1P07225 676 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HCCSP53701 268 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACTBP60709 375 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACTG1P63261 375 aa3.36□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms