RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam189a1Q6A044 515 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrd1Q80T32 903 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TxlngQ8BHN1 524 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ScaiQ8C8N2 606 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Far1Q922J9 515 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Yaf2Q99LW6 179 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2610042L04RikQ9D073 150 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hcar2Q9EP66 360 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nectin3Q9JLB9 549 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11758A2BEI6 360 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11757A2BEI8 360 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Capns1O88456 269 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccr7P47774 378 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab8aP55258 207 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sel1l2Q3V172 688 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnh1Q60603 989 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gngt2Q61017 69 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr6a1Q64249 495 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pex11gQ6P6M5 241 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr814Q7TRH4 310 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmcc2Q80W04 706 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AftphQ80WT5 931 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcas1Q80YN3 633 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rcn3Q8BH97 328 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SntnQ8C9X1 147 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glcci1Q8K3I9 537 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr985Q8VGB4 311 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fcf1Q9CTH6 198 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 S100pbpQ9D5K4 396 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc70Q9D9B0 223 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fhl5Q9WTX7 284 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asb4Q9WV71 426 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhox2bA2A447 191 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhox2cA2AWL9 191 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gbp4A4UUI3 631 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp992B1ASD8 573 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r238E9Q373 306 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc22a2O70577 553 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 JunP05627 334 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PfklP12382 780 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcf3P15806 651 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnrc1Q3TWH3 297 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 InipQ3TXT3 104 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KdsrQ6GV12 332 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr62Q80UC6 358 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wipi2Q80W47 445 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp595Q8BIN6 625 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam221bQ8C627 487 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tceal5Q8CCT4 200 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp991Q8R1N3 573 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usb1Q91W78 267 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fig4Q91WF7 907 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 L2hgdhQ91YP0 464 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcoln1Q99J21 580 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9CZV2 255 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FancgQ9EQR6 623 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ak1Q9R0Y5 194 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A0A286YCD0 109 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim17A0A504 109 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AprtP08030 180 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gon7P0C8B4 98 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HmbsP22907 361 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Csf2rb2P26954 878 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Htr5bP31387 370 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpat2Q14DK4 801 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Naf1Q3UMQ8 489 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Brinp2Q6DFY8 783 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q6PAC4 1279 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr26Q7TRB7 308 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PdprQ7TSQ8 878 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbbp8Q80YR6 893 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab39aQ8BHD0 217 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RorbQ8R1B8 470 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr447Q8VGP6 310 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Golga7Q91W53 137 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Man2c1Q91W89 1039 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Depdc7Q91WS7 511 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nos1apQ9D3A8 503 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr933Q9EQA0 308 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ern1Q9EQY0 977 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmeff2Q9QYM9 374 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpc6Q9R087 555 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2g1Q9WV19 494 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp964B2RR88 472 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20441G3UYJ7 252 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5571P01639 130 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apex1P28352 317 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Emx1Q04742 257 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxw18Q3TSA9 469 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 StimateQ3UF25 288 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppm1hQ3UYC0 513 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.7 ms