RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	AMZ1	Q400G9	498 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	LCTL	Q6UWM7	567 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	DRC3	Q9H069	523 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TAPBP	O15533	448 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	CRCP	O75575	148 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	FKBP9	O95302	570 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	HSPA4L	O95757	839 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	MLYCD	O95822	493 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	BGN	P21810	368 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	CDH3	P22223	829 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TGM1	P22735	817 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GRK2	P25098	689 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GDF5	P43026	501 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	OR1D5	P58170	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	NR1D2	Q14995	579 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	NCSTN	Q92542	709 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	BTN3A3	O00478	584 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	E2F3	O00716	465 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	MAP3K7	O43318	606 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TNFSF14	O43557	240 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	NPHS1	O60500	1241 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	OTC	P00480	354 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GP1BA	P07359	652 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	UGT2B7	P16662	529 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	GNAZ	P19086	355 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ACP1	P24666	158 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	PSMB5	P28074	263 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	LIMK1	P53667	647 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ABAT	P80404	500 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	CLC	Q05315	142 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	STX3	Q13277	289 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	RCN2	Q14257	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ICE2	Q659A1	982 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57

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