RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMIM18P0DKX4 95 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DARSP14868 501 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TNFAIP3P21580 790 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 JAK1P23458 1154 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTPN3P26045 913 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDHA2P29803 388 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TM4SF1P30408 202 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 OXTRP30559 389 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAPK4P31152 587 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACSL1P33121 698 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CAPGP40121 348 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MNDAP41218 407 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SOX3P41225 446 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GARSP41250 739 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRELPP51888 382 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LBX1P52954 281 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SIRPAP78324 504 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 IRX4P78413 519 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMF1P82094 1093 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NDPQ00604 133 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FCHO2Q0JRZ9 810 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LMOD3Q0VAK6 560 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDH18Q13634 790 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 IRF3Q14653 427 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CRYMQ14894 314 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAB1Q15750 504 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 EXT1Q16394 746 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 C3AR1Q16581 482 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CA9Q16790 459 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SYT14P1Q58G82 188 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPECC1Q5M775 1068 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC35D3Q5M8T2 416 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ELFN2Q5R3F8 820 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FHL5Q5TD97 284 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LCN1P1Q5VSP4 162 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SNX30Q5VWJ9 437 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NOTUMQ6P988 496 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM154Q6P9G4 183 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TEX38Q6PEX7 206 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMCO3Q6UWJ1 677 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NHLRC1Q6VVB1 395 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LEKR1Q6ZMV7 388 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 G2E3Q7L622 706 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HAUS6Q7Z4H7 955 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMPRSS11BQ86T26 416 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUDT13Q86X67 352 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM131BQ86XD5 332 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CEP57Q86XR8 500 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZBED8Q8IZ13 594 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADGRF2Q8IZF7 708 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPD1LQ8N335 351 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLHDC1Q8N7A1 406 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NPRL2Q8WTW4 380 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCFD2Q8WU76 684 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCDC107Q8WV48 283 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 USP6NLQ92738 828 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DHX58Q96C10 678 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF597Q96LX8 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM20AQ96MK3 541 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 C7orf26Q96N11 449 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NEK1Q96PY6 1258 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LGMNQ99538 433 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LPAR4Q99677 370 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 OLFM1Q99784 485 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHCHD5Q9BSY4 110 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC26A6Q9BXS9 759 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MIS12Q9H081 205 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 WNT5BQ9H1J7 359 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HRH4Q9H3N8 390 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBC1D17Q9HA65 648 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRPV4Q9HBA0 871 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 Q9N2K0 584 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TNFRSF19Q9NS68 423 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GKN1Q9NS71 199 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANAPC11Q9NYG5 84 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 B4GALT7Q9UBV7 327 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSPAN16Q9UKR8 245 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLAGL1Q9UM63 463 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 STUB1Q9UNE7 303 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF148Q9UQR1 794 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC6A5Q9Y345 797 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NME7Q9Y5B8 376 aa0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms