RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 FOSL2P15408 326 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 GNB3P16520 340 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 EPHA2P29317 976 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ALDH4A1P30038 563 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MELKQ14680 651 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ADALQ6DHV7 355 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 LINGO4Q6UY18 593 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PSD2Q9BQI7 771 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 HHATLQ9HCP6 504 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 USP16Q9Y5T5 823 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 LTBP2Q14767 1821 aa4.14□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 AGAP14A8MT82 685 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 NR5A2O00482 541 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CLIC2O15247 247 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PLA2G4BP0C869 781 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MMP9P14780 707 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MFAP4P55083 255 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 UBXN2AP68543 259 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PRKAA1Q13131 559 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SUSD4Q5VX71 490 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 RAET1EQ8TD07 263 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 LRR1Q96L50 414 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 FAM81BQ96LP2 452 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SGK494Q96LW2 274 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 TIGD1Q96MW7 591 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ASCL2Q99929 193 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 KCNK15Q9H427 330 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MAST2Q6P0Q8 1798 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 OR2A25A4D2G3 310 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 A6NCN8 305 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SH3BP5O60239 455 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ITGA3P26006 1051 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 HOXD13P35453 343 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PNLIPRP2P54317 469 aa4.12□□□□□ -1.75
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PDE4D-220ENST00000512069 CREB5Q02930 508 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 GRAPQ13588 217 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 FCN2Q15485 313 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 C14orf177Q52M58 125 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ALS2CLQ60I27 953 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 DEFB118Q96PH6 123 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 OR6C1Q96RD1 312 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 RTN4RQ9BZR6 473 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 GHITMQ9H3K2 345 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SIX2Q9NPC8 291 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 POLLQ9UGP5 575 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CACNA1BQ00975 2339 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 AK9Q5TCS8 1911 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 CACNA1GO43497 2377 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 LNP1A1A4G5 178 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 OR6C76A6NM76 312 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 B4DLN1 442 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 ERVV-1B6SEH8 477 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 PLOD2O00469 737 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-220ENST00000512069 SSX4O60224 188 aa4.11□□□□□ -1.75
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