RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 GUSBP11Q6P575 273 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL35Q6PF15 583 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SPRED1Q7Z699 444 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 OR10G6Q8NH81 332 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 LCN9Q8WX39 176 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SMPDL3AQ92484 453 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 RSC1A1Q92681 617 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 EXT2Q93063 718 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR34Q96EX3 536 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 TRMOQ9BU70 441 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 WWOXQ9NZC7 414 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 POMT2Q9UKY4 750 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 RP1P56715 2156 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 K7EPI3 171 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 MATN2O00339 956 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 NPHS1O60500 1241 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 DKK1O94907 266 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 MYF5P13349 255 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 NPPBP16860 134 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 AMD1P17707 334 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 GRK2P25098 689 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CSF2RBP32927 897 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CASP2P42575 452 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 PIK3CGP48736 1102 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 HSPA7P48741 367 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 OCRLQ01968 901 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CFHR1Q03591 330 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAF3Q13114 568 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 NAE1Q13564 534 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 KIR2DS3Q14952 304 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 PERM1Q5SV97 790 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 LCTLQ6UWM7 567 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 LSMEM2Q8N112 164 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CARFQ8N187 725 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 PHF21BQ96EK2 531 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF382Q96SR6 550 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 EGFL8Q99944 293 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 EHD1Q9H4M9 534 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 XKR8Q9H6D3 395 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 PDP2Q9P2J9 529 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF225Q9UK10 706 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GTL3 188 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM114B3SHH9 223 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 OR7A17O14581 309 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 GIPC1O14908 333 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 B4GAT1O43505 415 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 WFS1O76024 890 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 UBXN7O94888 489 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 C9P02748 559 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 BGNP21810 368 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-207ENST00000454947 CD1CP29017 333 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms