RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR14I1A6ND48 311 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCKBRP32239 447 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ADAM8P78325 824 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TUBA3CQ13748 450 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EPGNQ6UW88 154 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARVCFO00192 962 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CHP2O43745 196 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TBX10O75333 385 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ITGA10O75578 1167 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PGLSO95336 258 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NR2C1P13056 603 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 POU2F1P14859 743 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FPR1P21462 350 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RHDQ02161 417 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KAT2AQ92830 837 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LGR4Q9BXB1 951 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FZD4Q9ULV1 537 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RCBTB2O95199 551 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AHSGP02765 367 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GNALP38405 381 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TAS2R50P59544 299 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SATL1Q86VE3 508 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF527Q8NB42 609 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 COL21A1Q96P44 957 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF358Q9NW07 568 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MED31Q9Y3C7 131 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GMEB1Q9Y692 573 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SHPRHQ149N8 1683 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACVR2AP27037 513 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DNAJB13P59910 316 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GHRHRQ02643 423 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCNC3Q14003 757 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM198Q66K66 360 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ING5Q8WYH8 240 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCTD7Q96MP8 289 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MNTQ99583 582 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-219ENST00000454741 COQ9O75208 318 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CD36P16671 472 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ENGP17813 658 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.033e-7■■■■□ 24.6
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACTR1BP42025 376 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GSK3BP49841 420 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACTR1AP61163 376 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CBLBQ13191 982 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GPR17Q13304 367 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RAB30Q15771 203 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DKK3Q9UBP4 350 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SPEF2Q9C093 1822 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACSL1P33121 698 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TUBA1BP68363 451 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TUBA4AP68366 448 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EMX2Q04743 252 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CHRNA6Q15825 494 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TUBA1AQ71U36 451 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AASSQ9UDR5 926 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MAGP20916 626 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GPX6P59796 221 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TSPAN5P62079 268 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STX12Q86Y82 276 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR52B2Q96RD2 323 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IFT46Q9NQC8 304 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR51F1A6NGY5 319 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms