RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 TRIM46Q7Z4K8 759 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SETD9Q8NE22 299 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 POLE4Q9NR33 117 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ABCG2Q9UNQ0 655 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 TPRKBQ9Y3C4 175 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GSNP06396 782 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PSMB9P28065 219 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 TGFBR1P36897 503 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SERPINB10P48595 397 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SLC11A2P49281 568 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CATSPEREQ5SY80 951 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 WBP2Q969T9 261 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 EID2BQ96D98 161 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 INPP5KQ9BT40 448 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 AP3M1Q9Y2T2 418 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 TTC36A6NLP5 189 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ULK1O75385 1050 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PRAMEF12O95522 483 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 FADS2O95864 444 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CA5AP35218 305 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SGSHP51688 502 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PHKG1Q16816 387 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 LRIF1Q5T3J3 769 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CIPCQ9C0C6 399 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ASIC5Q9NY37 505 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ZNF232Q9UNY5 417 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 STC2O76061 302 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 BCKDHAP12694 445 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 IL1RL1Q01638 556 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 TPGS2Q68CL5 300 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 STK40Q8N2I9 435 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ADGRE3Q9BY15 652 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 OARD1Q9Y530 152 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PTPN6P29350 595 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 TWF1Q12792 350 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 MTA1Q13330 715 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 KEAP1Q14145 624 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ANKRD46Q86W74 232 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 APOL5Q9BWW9 433 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CD244Q9BZW8 370 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ACOT13Q9NPJ3 140 aa24.04■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CBX4O00257 560 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 MANBAO00462 879 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PRRG1O14668 218 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PER2O15055 1255 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ERN1O75460 977 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GSTT2P0CG29 244 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GSTT2BP0CG30 244 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ACRP10323 421 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CDKN2CP42773 168 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CDH4P55283 916 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CXCR4P61073 352 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 CACNG1Q06432 222 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 MAPK11Q15759 364 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 BCL2A1Q16548 175 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 KDM4DQ6B0I6 523 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 RNF165Q6ZSG1 346 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 EGFL8Q99944 293 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 BOCQ9BWV1 1114 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 KCNH6Q9H252 994 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 IL17CQ9P0M4 197 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 OPTCQ9UBM4 332 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 A0A096LPI6 279 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 EPHA2P29317 976 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GRK3P35626 688 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SLC14A1Q13336 389 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SNX20Q7Z614 316 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 MYOCQ99972 504 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SCN3BQ9NY72 215 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa24.03■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 LTBP2Q14767 1821 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ST13P50502 369 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GTF2H3Q13889 308 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ZNF540Q8NDQ6 660 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms