RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 PRPH2P23942 346 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HSD3B2P26439 372 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HTR1BP28222 390 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PDHA2P29803 388 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CPOXP36551 454 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PGM1P36871 562 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GDF5P43026 501 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CCR5P51681 352 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CLCNKAP51800 687 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RAP1GDS1P52306 607 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 STARD6P59095 220 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PFN3P60673 137 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KCNJ2P63252 427 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 EMX2Q04743 252 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LAPTM5Q13571 262 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 E2F2Q14209 437 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FGL2Q14314 439 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RINLQ6ZS11 566 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SNX31Q8N9S9 440 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NAT14Q8WUY8 206 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 USP7Q93009 1102 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 REPS1Q96D71 796 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C3orf30Q96M34 536 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FAM161BQ96MY7 647 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CATSPER2Q96P56 530 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SERPINI1Q99574 410 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 EHD1Q9H4M9 534 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ASIC5Q9NY37 505 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ASB1Q9Y576 335 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TIMM22Q9Y584 194 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CDH23Q9H251 3354 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 H0YIV9 168 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MANBAO00462 879 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LATO43561 262 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ATP6AP2O75787 350 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CIB2O75838 187 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KRT34O76011 436 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SEMA4FO95754 770 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CEACAM5P06731 702 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 JUPP14923 745 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GABRG2P18507 467 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IDSP22304 550 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GPX3P22352 226 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MAPK1P28482 360 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 AKT2P31751 481 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GNPDA1P46926 289 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PREPP48147 710 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IRF8Q02556 426 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ART3Q13508 389 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NAE1Q13564 534 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LRP8Q14114 963 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NFE2L1Q14494 772 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NFATC4Q14934 902 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IMPG1Q17R60 797 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KIF19Q2TAC6 998 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SPATS1Q496A3 300 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms