RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FGF11Q92914 225 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 OR6C1Q96RD1 312 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TAAR9Q96RI9 348 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 DDA1Q9BW61 102 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 GPAMQ9HCL2 828 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FAM60AQ9NP50 221 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PDE10AQ9Y233 779 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 BTRCQ9Y297 605 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CDC7O00311 574 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC16A5O15375 505 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 RIPK2O43353 540 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 HCRTR1O43613 425 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TIAF1O95411 115 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC16A8O95907 504 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 C8GP07360 202 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ZNF28P17035 718 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CYP2A7P20853 494 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 MAGP20916 626 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TNFRSF8P28908 595 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 IMPA1P29218 277 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ARL4DP49703 201 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PNLIPRP1P54315 467 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC12A2P55011 1212 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 RAB15P59190 212 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 RAB10P61026 200 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 HSD11B2P80365 405 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SP140Q13342 867 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TUBB3Q13509 450 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TGIF1Q15583 401 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 GPR19Q15760 415 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SBSNQ6UWP8 590 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CARFQ8N187 725 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ZNF480Q8WV37 535 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CYTH2Q99418 400 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PRR14Q9BWN1 585 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PARVBQ9HBI1 364 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.34□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 E7ENX8 843 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 NRP2O60462 931 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CTSBP07858 339 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ABHD2P08910 425 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 FGF5P12034 268 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CD1DP15813 335 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 STMN1P16949 149 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 GABRA4P48169 554 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 VSNL1P62760 191 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ACY1Q03154 408 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 TAP2Q03519 686 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 DLG1Q12959 904 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-216ENST00000495123 CLN3Q13286 438 aa8.33□□□□□ -1.08
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