RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 GPS2Q13227 327 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 DNASE1L3Q13609 305 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TRADDQ15628 312 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TBR1Q16650 682 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 LINC00303Q3SY05 128 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 STEAP4Q687X5 459 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 LCN10Q6JVE6 187 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 C16orf46Q6P387 395 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 BBOF1Q8ND07 529 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR8K5Q8NH50 307 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 STARD8Q92502 1023 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZNF592Q92610 1267 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 INPP5DQ92835 1189 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MR1Q95460 341 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 LRRC39Q96DD0 335 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PKP4Q99569 1192 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 DHRS7Q9Y394 339 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.23□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 E7EQ34 232 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 H3BMH7 237 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MYO1CO00159 1063 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MEN1O00255 615 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZNF749O43361 778 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 NRP2O60462 931 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PIAS1O75925 651 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR2B3O76000 313 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CATP04040 527 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ITGB2P05107 769 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FAM87AP0C7U9 286 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MSL3P1P0C860 447 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MPC1LP0DKB6 136 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RORAP35398 523 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GRIA3P42263 894 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CDC20Q12834 499 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ERV3-1Q14264 604 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CYP2A13Q16696 494 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 DUPD1Q68J44 220 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FCRL6Q6DN72 434 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 DSELQ8IZU8 1212 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GPATCH11Q8N954 259 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 EXD3Q8N9H8 876 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ASB11Q8WXH4 323 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MIPEPQ99797 713 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CHST8Q9H2A9 424 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ACTL8Q9H568 366 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.22□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms